Σύμφωνα με την μυθολογία ο θεός Ασωπός είχε 20 κόρες, η πιο εντυπωσιακή σε ομορφιά και φινέτσα ήταν η Αίγινα. Ο Δίας την ερωτεύθηκε και την απήγαγε.
Προϊστορικά οι πρώτοι κάτοικοι εμφανίστηκαν την 4η χιλιετηρίδα π.Χ.
Τον 6ο αιώνα π.Χ. η Αίγινα είχε μεγάλη ευμάρεια με δικαστήρια και ιατρικές υπηρεσίες, εμπορικό και στρατιωτικό λιμάνι και πληθυσμό 40.000 κατοίκους και 400.000 δούλους.
Το 500 π.Χ. έλεγχε σημαντικά το εμπόριο της ανατολικής μεσογείου και έφτασε στο υψηλότερο σημείο δύναμης και πλούτου.
Το 1828 ο Ιωάννης Καποδίστριας εγκαθιστά στην Αίγινα την πρώτη Ελληνική κυβέρνηση και η Αίγινα γίνεται η πρώτη πρωτεύουσα της ελεύθερης Ελλάδας, εκεί υπογράφονται οι σημαντικότερες αποφάσεις για τα θεμέλια της σύστασης του διαλυμένου από τους Τούρκους κράτους.
Περίπου ένα χρόνο μετά η πρωτεύουσα μεταφέρεται στο Ναύπλιο, ο πληθυσμός μειώνεται καθώς και η προσωρινή άνοδος του νησιού.